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学術誌論文Scientific Papers

  • Ohashi, H. and Miyamoto-Sato, E.: Next-generation sequencing technologies for multi-omics approaches.
    Journal of Biomedicine and Biotechnology
    in press.
  • Miyamoto-Sato, E.: Next-generation sequencing coupled with a cell-free display technology for reliable interactome of transcriptional factors.
    Methods Mol. Biol.
    1164, pp.23-32 (2014) PubMed
  • Ohashi, H., Fujimori, S., Hirai, N., Yanagawa H., Miyamoto-Sato, E.: Analysis of Transcription Factor Networks Using IVV Method.
    Methods Mol. Biol.
    1164, pp.15-22 (2014) PubMed
  • Akiyama, T., Shiraishi, T., Qin, J., Konno, H., Akiyama, N., Shinzawa, M., Miyauchi, M., Takizawa, N., Yanai, H., Ohashi, H., Miyamoto-Sato, E., Yanagawa H., Yong, W., Shou, W., and Inoue, J.: Mitochondria–nucleus shuttling FK506-binding protein 51 interacts with TRAF proteins and facilitates the RIG-I-like receptor-mediated expression of type I IFN.
    PLoS ONE
    9(5):e95992 (2014) PubMed
  • Ohashi, H. and Miyamoto-Sato, E.: Toward personalized medicine mediated by mRNA display-based interactome approaches.
    International Journal of Molecular Sciences
    5(4):6717-24 (2014) PubMed
  • Ohashi, H., Ishizaka, M., Hirai, N., and Miyamoto-Sato, E.:　Efficiency of puromycin-based technologies mediated by release factors and a ribosome recycling factor.
    Protein Engineering, Design and Selection
    : 1–5 : (2013) PubMed
  • Fujimori S., Hirai N., Ohashi H., Masuoka K., Nishikimi A., Fukui Y., Washio T., Oshikubo T., Yamashita T. & Miyamoto-Sato, E.: Next-generation sequencing coupled with a cell-free display technology for high-throughput production of reliable interactome data.
    Scientific Reports
    2:691 (2012) PubMed
  • Fujimori, S., Hino, K., Saito, A., Miyano, S., Miyamoto-Sato, E.*: PRD: A protein–RNA interaction database.
    Bioinformation
    , 8 (15): (2012) PubMed
  • Fujimori, S., Hirai, H., Masuoka, K., Oshikubo, T., Yamashita, T., Washio, T., Saito, A., Nagasaki, M., Miyano, S., Miyamoto-Sato, E.: IRView: a database and viewer for protein interacting regions.
    Bioinformatics
    28(14):1949-1950 (2012) PubMed
  • Ohashi, H., Miyamoto-Sato, E.: A next generation evolutionary molecular engineering system and the future prospects.
    Viva origino
    40 suppl (2012)
  • Ozawa, Y., Saito, R., Fujimori, S., Kashima, H., Ishizaka, M., Yanagawa, H., Miyamoto-Sato E., Tomita, M.: Protein complex prediction via verifying and reconstructing the topology of domain-domain interactions.
    BMC Bioinformatics
    , 11:350. (2010) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E., Fujimori, S., Ishizaka, M., Hirai, N., Masuoka, K., Saito, R., Ozawa, Y., Hino, K., Washio, T., Tomita, M., Yamashita, T., Oshikubo, T., Akasaka, H., Sugiyama, J., Matsumoto, Y., and Yanagawa, H.: A comprehensive resource of interacting protein regions for refining human transcription factor networks.
    PLoS ONE
    , Feb 24;5(2):e9289 (2010) PubMed
  • Matsumura, N., Tsuji, T., Sumida, T., Kokubo, M., Onimaru, M., Doi, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Yanagawa, H.: mRNA display selection of a high-affinity, Bcl-XL-specific binding peptide.
    FASEB J.
    24(7):2201-10 (2010) PubMed
  • FANTOM Consortium, Suzuki, H., Miyamoto-Sato, E.(137名中89番目), Hayashizaki, Y.: The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line.
    Nat Genet.
    41(5):553-62. (2009) PubMed
  • Tabata, N., Sakuma, Y., Honda, Y., Doi, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato E., Yanagawa, H.: Rapid antibody selection by mRNA display on a microfluidic chip.
    Nucleic Acids Res.
    , 37, e64 (2009) PubMed
  • Tsuji, T., Onimaru, M., Doi, N., Miyamoto-Sato, E., Takashima, H., Yanagawa, H.: In vitro selection of GTP-binding proteins by block shuffling of estrogen-receptor fragments.
    Biochem. Biophys. Res. Commun.
    ，390(3):689-93. (2009) PubMed
  • Kosugi, S., Hasebe, M., Matsumura, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Tomita, M., Yanagawa, H.: Six classes of nuclear localization signals specific to different binding grooves of importin alpha.
    J Biol Chem.
    284(1):478-85 (2009) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E.*, Yanagawa, H.: Puromycin technology for in vitro evolution and proteome exploration.
    Viva Origino
    34 (4):148-154 (2007) Journal site
  • Fukuda, I., Kojoh, K., Tabata, N., Doi, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Yanagawa, H.: In vitro evolution of single-chain antibodies using mRNA display.
    Nucleic Acids Res.
    34(19):e127 (2006) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H.: Toward functional analysis of protein interactome using "in vitro virus": In silico analyses of Fos/Jun interactors.
    J Drug Target
    14(7):505-11 (2006) PubMed
  • Oyama, R., Takashima, H., Yonezawa, M., Doi, N., Miyamoto-Sato, E., Kinjo, M., Yanagawa, H.: Protein-protein interaction analysis by C-terminally specific fluorescence labeling and fluorescence cross-correlation spectroscopy.
    Nucleic Acids Res.
    34(14):e102 (2006) PubMed
  • Tateyama, S., Horisawa, K., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Doi, N., Yanagawa, H.: Affinity selection of DNA-binding protein complexes using mRNA display.
    Nucleic Acids Res.
    34, e27 (2006) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H.: Puromycin technology originated from evolutionary molecular engineering for analyses of protein interactions.
    Viva Origino
    , 34: 22 (2006)
  • Ishizaka, M., Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H.: Search for functional units of proteins by the analysis of protein-protein interactions using IVV.
    Viva Origino
    34: 27 (2006)
  • Miyamoto-Sato, E., Ishizaka, M., Horisawa, K., Tateyama, S., Takashima, H., Fuse S., Sue, K., Hirai, N., Masuoka, K., Yanagawa, H.: Cell-free co-translation and selection using in vitro virus for high-throughput analysis of protein-protein interactions and complexes.
    Genome Res.
    15 (5):710-717 (2005) PubMed
  • Burnette, J.M., Miyamoto-Sato, E., Schaub, M.A., Conklin, J., Lopez, A.J.: Subdivision of Large Introns in Drosophila by Recursive Splicing at Non-exonic Elements.
    Genetics.
    , 170 (2): 661-674 (2005) PubMed
  • Horisawa, K., Tateyama, S., Ishizaka, M., Matsumura, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Doi, N. and Yanagawa, H.: In vitro selection of Jun-associated proteins using mRNA display.
    Nucleic Acids Res.
    , 32(21): e169 (2004) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E., Takashima, H., Fuse, S., Sue, K., Ishizaka, M., Tateyama, S., Horisawa, K., Sawasaki, T., Endo, Y., and Yanagawa, H.: Highly stable and efficient mRNA templates for mRNA-protein fusions and C-terminally labeled proteins.
    Nucleic Acids Res.
    , 31 (15): e78 (2003) PubMed
  • Kawahash, Y., Doi, N., Takashima, H., Tsuda, C., Oishi, Y., Oyama, R., Yonezawa, M., Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H.: In vitro protein microarrays for detecting protein-protein interactions: Application of a new method for fluorescence labeling of proteins.
    Proteomics
    , 3 (7): 1236-1243 (2003) PubMed
  • Doi, N., Takashima, H., Kinjo, M., Sakata. K., Kawahashi, Y., Oishi, Y., Oyama, R., Miyamoto-Sato, E., Sawasaki, T., Endo, Y., and Yanagawa, H.: Novel fluorescence labeling and high-throughput assay technologies for In vitro analysis of protein interactions.
    Genome Res.
    , 12 (3): 487-492 (2002) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E., Nemoto, N., Kobayashi, K. and Yanagawa, H.: Specific bonding of puromycin to full-length protein at the carboxyl terminus.
    Nucleic Acids Res.
    , 28 (5): 1176-1182 (2000) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E., Burnette, J.M., Bomze, H.M., Lopez, A.J., Kobayashi, K. and Yanagawa, H.: Stepwise removal of a large intron mediated by a zero-nucleotide exon and its implication of genes and proteins evolution.
    Viva Origino
    , 28: 28 (2000)
  • Miyamoto-Sato, E., Nemoto, N., Kobayashi, K. and Yanagawa, H.: Specific bonding of puromycin for construction of a genotype-phenotype assignment molecule on in vitro selection of proteins.
    Viva Origino
    , 28: 27 (2000)
  • Miyamoto-Sato, E., Nemoto, N., Kobayashi, K. and Yanagawa, H.: Specific bonding of puromycin for construction of a genotype-phenotype assignment molecule on in vitro selection of proteins.
    Viva Origino
    , 28, pp. 27-27, 2000.
  • Nemoto, N., Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H. ：Fluorescence labeling of the C-terminus of proteins with a puromycin analogue in cell-free translation systems.
    FEBS Lett.
    , 462 (1-2): 43-46 (1999) PubMed
  • Nemoto, N., Miyamoto-Sato, E., Hushimi, Y. and Yanagawa, H.: In vitro virus: Bonding of mRNA bearing puromycin at the 3'-terminal end to the C-terminal end of its encoded protein on the ribosome in vitro.
    FEBS Lett.
    , 414 (2): 405-408 (1997) PubMed
  • Miyamoto-Sato, E., Nemoto, N., Hushimi, H., Kobayashi, K. and Yanagawa, H.: The construction of the virus type assignment molecule in evolutionary molecular engineering.
    Viva Origino
    , 25 (1), pp.35-35, 1997.
  • Takahashi, K., Miyamoto, E., Shoji, K., and Tamaru, K.: Dynamic behavior of reaction intermediate on catalyst surfaces in the working state: Behavior of formate ion during the decomposition of formic acid on Ni/Sio2 catalyst.
    Catalysis Letters
    , 1: 213-216 (1988) Journal site

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総説Review papers

  • 宮本悦子，大橋広行，長谷川舞衣，脇本健太郎：次世代シーケンシングによるインタラクトーム解析
    月刊『細胞』特集—がんの分子標的に向けたゲノミクス−
    2014年9月, in press.
  • 宮本悦子：グローバル時代だからこそ、日本発のテクノロジーで未来を拓け！
    東京理科大学,「科学フォーラム」特集／第５１回学位志徳車記念講演会・祝賀会
    2013年12月, pp.14-15 (2013)
  • 2. 宮本悦子、西川純一：インタラクトームが拓くパーソナル医療への展望
    羊土社，『実験医学』（増刊）「ゲノム　医学・生命科学研究」総集編
    2013年9月, pp.93-99 (2013)
  • 宮本悦子：ピューロマイシンテクノロジが拓く化学→バイオ→医学の世界
    横浜国立大学『国大化学会会誌』「OB/OGと語る会」
    第11号，9月号 pp20-21 (2013)
  • 藤森茂雄, 佐谷秀行, 宮本悦子: タンパク質間相互作用ネットワーク解析によるがん個性の理解
    システムがんNewsletter
    2, pp.4-4 (2011)
  • 宮本悦子：日の丸印のテクノロジーの誕生ーポストゲノム時代からパーソナル時代へ向けて－
    化学経済
    ５月号: 73-76 (2011)
  • 宮本悦子，柳川弘志：生物機能解明に向けたin vitro virus(IVV)法によるゲノムネットワーク解析,
    蛋白・核酸・酵素
    49(17 Suppl): 2768-2774 (2004)
  • 宮本悦子，柳川弘志：In vitro virus法による遺伝子ネットワーク解析,
    Bioベンチャー
    7-8: 61-64 (2004)
  • 宮本悦子，柳川弘志：In vitro virusおよびC末端ラベル化法のポストゲノム研究への応用，
    蛋白・核酸・酵素
    48(11 Suppl): 1474-80 (2003)
  • 宮本悦子，柳川弘志：ピューロマイシンの進化分子工学と遺伝子ネットワーク解析への応用，
    蛋白・核酸・酵素
    46(2):138-47 (2001)

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著書Books

  • Miyamoto-Sato, E. et al. (eds.): Transcription Factor Regulatory Networks -
    Springer Protocols: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology
    1164, ISBN 978-1-4939-0804-2 (2014) Book site
  • Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Application of In vitro virus technique for high-throughput analysis of protein-protein interactions.
    Cell-Free Expression
    18, pp.208-217, Kudlicki,W., Katzen,F., & Bennett, R.(eds.), ISBN 978-1-58706-123-3, (2007)
  • Miyamoto-Sato, E. and Yanagawa, H.: Puromycin technology for proteome exploration using cell-free translation systems.
    Recent Devel. Nucleic Acid Res.
    2: 163-173 (2006) Book site
  • 宮本悦子、柳川弘志 (伊藤隆司、谷口寿章編)：In vitro virus法によるタンパク質相互作用と遺伝子ネットワーク解析、中山書店、ポストシークエンスのゲノム科学３プロテオミクス、p.136-145(2000)

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国際特許 (登録)International Patents

  • Miyamoto, E., Horisawa, K., Yanagawa, H.: PROTEIN FORMING COMPLEX WITH c-Jun PROTEIN, NUCLEIC ACID ENCODING THE SAME AND METHOD OF USING THE SAME. US7838243 (29th, Nov. 2011)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E.: Labeled protein and its producing method, labeling compound to be used in the method for analyzing function of genes. US7041446 (2006)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E., Fusimi, Y.: Molecule that homologizes genotype and phenotype and utilization thereof. EP962527 (2004)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E., Fusimi, Y.: Molecule assigning genotype to phenotype and use thereof. EP1477561 (2004)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E., Fusimi, Y.: Molecule assigning genotype to phenotype and use thereof. US20020046722 (2002)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E., Fusimi, Y.: Molecule that homologizes genotype and phenotype and utilization thereof. US6361943 (2002)
  • Yanagawa, H., Nemoto, N., Miyamoto, E.: Labeled protein and its producing method, labeling compound to be used in the method for analyzing function of genes. US6228994 (2001)
  • Murata, H., Izumi, T., Nakamura, Y., Miyamoto, E.: Method of manufacturing developing agent, US5698356 (1997)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Kaga, E.: Electronograph developing agent and method of manufacturing the same. US5604068 (1997)

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国際特許 (出願)International Patent Applications

  • Miyamoto, E., Tsuji, T., Fujimori, S., Ishizaka, M.: CONSTITUTION OF TOOL FOR ANALYZING BIOMOLECULAR INTERACTION AND ANALYSIS METHOD USING SAME. PCT/ European Patent /2554681 (2013)
  • Miyamoto, E., Tsuji, T., Fujimori, S., Ishizaka, M.: CONSTITUTION OF TOOL FOR ANALYZING BIOMOLECULAR INTERACTION AND ANALYSIS METHOD USING SAME. PCT/ US Patent/ 2013/0196331 (2013)
  • Miyamoto, E., Tsuji, T., Fujimori, S., Ishizaka, M.: CONSTITUTION OF TOOL FOR ANALYZING BIOMOLECULAR INTERACTION AND ANALYSIS METHOD USING SAME. PCT/ Japan Patent /WO2011/125833 (2013)
  • Miyamoto, E., Horisawa, K., Yanagawa, H.: PROTEIN FORMING COMPLEX WITH c-Jun PROTEIN, NUCLEIC ACID ENCODING THE SAME AND METHOD OF USING THE SAME. German Patent Application No. 11 2004 002 217.7-41 (29th, Nov. 2011)
  • Miyamoto, E., Tsuji, T., Fujimori, S., Ishizaka, M.: CONSTITUTION OF TOOL FOR ANALYZING BIOMOLECULAR INTERACTION AND ANALYSIS METHOD USING SAME. PCT/JP2011/058203 (2011)
  • Miyamoto, E., Washio, T., Ishizaka, M., Yanagawa, H.: METHOD FOR OBTAINING ARRAY DATA, METHOD FOR EXTRACTING TARGET GENE BY USING THE SAME, AND METHOD FOR DESIGNING PROTEIN. PCT/JP2006/0329313 (2006)
  • Miyamoto, E. and Yanagawa, H.: METHOD OF FORMING INTERACTION MAP WITH THE USE OF GENE AND/OR PROTEIN DATA BASE AND SOFTWARE AND APPARATUS FOR THE EMBODIMENT THEREOF. PCT/JP2004/017362 (2004)
  • Miyamoto, E., Ishizaka, M., Yanagawa, H.: Protein forming complex with c-fos protein, nucleic acid encoding the same and method of using the same. PCT/JP2003/014749 (2003)
  • Miyamoto, E., Takashima, H., Yanagawa, H.: TRANSLATION TEMPLATES AND LIBRARY THEREOF, PROTEINS SYNTHESIZED THEREFROM AND PROTEIN LIBRARY, CONSTITUENTS THEREOF, PROCESS FOR PRODUCING THE SAME AND METHOD OF USING THE SAME. PCT/JP2003/07508 (2003)
  • Miyamoto, E., Ishizaka, M., Yanagawa, H.: METHOD OF CONSTRUCTING ASSIGNED MOLECULE AND LIBRARY COMPRISING THE SAME AND METHOD OF USING THE SAME. PCT/JP2003/014750 (2003)
  • Yanagawa, H., Miyamoto, E., Matsumira, N., Doi, N., Tateyama, S., Ishizaka, M., Horisawa, K.: METHOD OF DETECTING INTERACTION BETWEEN SUBSTANCE AND PROTEIN, METHOD OF SCREENING PROTEIN INTERACTING WITH SUBSTANCE, AND METHOD OF FORMING COMPLEX OF SUBSTANCE AND PROTEIN INTERACTING WITH THE SUBSTANCE. PCT/JP2002/008078 (2002)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Kaga, E.: DEVELOPER AND METHOD OF MANUFACTURING THE SAME. PCT/JP2002/0304686 (2002)
  • Miyamoto, E., Takashima, H., Yanagawa, H.: Molecule for assigning genotype to phenotype and components thereof as well as method for constructing assigning molecule and method for utilizing assigning molecule. PCT/JP2001/010862 (2001)
  • Yanagawa, H., Doi, N., Miyamoto, E., Takashima, H., Oyama, R.: C-terminal modified protein and method for producing the same, modifying agent and translation template used for producing C-terminal modified protein, and method for detecting protein interaction with use of C-terminal modified protein. PCT/JP2001/010731 (2001)
  • Miyamoto, E., Takashima, H., Yanagawa, H.: COMPLEX OF ASSIGNED MOLECULE WITH C-END LABELED PROTEIN, ASSIGNED MOLECULE COMPLEX AND METHODS OF ANALYZING INTERACTION BETWEEN PROTEINS USING THESE COMPLEXES. PCT/JP2001/12864 (2001)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Nakamura, Y.: IRREGULAR ELECTROPHOTOGRAPHIC TONER. PCT/JP2001/0383677 (2001)
  • Nakamura, Y., Izumi, T., Murata, H., Miyamoto, E.: IMAGE FORMING METHOD, IMAGE FORMING DEVICE, DEVELOPER REMOVING METHOD AND ITS DEVICE. PCT/JP1995/0214361 (1995)
  • Izumi, T., Murata, H., Nakamura, Y., Miyamoto, E.: DEVELOPER FOR IMAGE FORMING DEVICE. PCT/JP1995/0131976 (1995)
  • Nakamura, Y., Izumi, T., Murata, H., Miyamoto, E.: ELECTROPHOTOGRAPHIC DEVELOPER AND METHOD FOR FIXING IMAGE. PCT/JP1994/0273120 (1994)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Nakamura, Y.: DEFORMED RESIN PARTICLE, DEFORMING METHOD OF RESIN PARTICLE AND TONER FOR ELECTROPHOTOGRAPHY COMPOSED OF DEFORMED RESIN PARTICLE. PCT/JP1994/0271139 (1994)
  • Izumi, T., Murata, H., Nakamura, Y., Miyamoto, E.: ELECTROPHOTOGRAPHIC DEVELOPER AND IMAGE FORMING METHOD. PCT/JP1994/0242649 (1994)
  • Murata, H., Miyamoto, E., Nakamura, Y.: DEVELOPING METHOD AND DEVELOPING DEVICE USING THE METHOD. PCT/JP1994/0207182 (1994)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Nakamura, Y., Kaga, H.: MICRON-SIZE POLYMER PARTICLE AND ITS PRODUCTION. PCT/JP1994/0083621 (1994)
  • Murata, H., Kaga, H., Miyamoto, E., Nakamura, Y.: DEVELOPER AND IMAGE FORMING DEVICE. PCT/JP1994/0063749 (1994)
  • Miyamoto, E., Murata, H., Kaga, H.: MANUFACTURE OF RESIN PARTICLE AND DEVELOPING AGENT. PCT/JP1994/0051952 (1994)
  • Murata, H., Kaga, H., Miyamoto, E.: DEVELOPER AND IMAGE FORMING DEVICE USING THE DEVELOPER. PCT/JP1993/0236006 (1993)
  • Miyamoto, E., Kamiyama, M., Kaga, H., Murata, H.: ELECTROSTATIC LATENT IMAGE DEVELOPING DEVELOPER. PCT/JP1993/0176993 (1993)
  • Kaga, H., Murata, H., Miyamoto, E.: ELECTROPHOTOGRAPHIC DEVELOPER. PCT/JP1993/0067096 (1993)
  • Kaga, H., Murata, H., Miyamoto, E.: DEVELOPER AND IMAGE FORMING DEVICE. PCT/JP1993/0066294 (1993)
  • Kaga, H., Murata, H., Miyamoto, E.: CLEANING DEVICE. PCT/JP1992/0253263 (1992)
  • Murata, H., Kaga, H., Miyamoto, E.: IMAGE FORMING METHOD FOR ELECTROPHOTOGRAPHIC DEVELOPER. PCT/JP1992/0253263 (1992)
  • Murata, H., Izum, T., Seto, S., Miyamoto, E.: IMAGE FORMING DEVICE AND DEVELOPER. PCT/JP1991/0344711 (1991)
  • Seto, S., Miyamoto, E., Izumi, T., Murata, H.: IMAGE FORMING DEVICE. PCT/JP1991/0284779 (1991)
  • Miyamoto, E., Seto, S., Izumi, T., Murata, H.: IMAGE FORMING METHOD.PCT/JP1991/0284769 (1991)
  • Izumi, T., Murata, H., Seto, S., Miyamoto, E.: IMAGE FORMING DEVICE. PCT/JP1991/0173668 (1991)

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国内特許 (登録)National Patents

  • 柳川弘志，宮本悦子，高嶋秀昭: 遺伝子型と表現型の対応付け分子とその構成要素，および対応付け分子の製法と利用方法，特願2000-380562, 特許4963142 (2012.4.6)
  • 宮本悦子，柳川弘志，高嶋秀昭：翻訳テンプレートおよびそのライブラリー，それから合成される蛋白質および蛋白質のライブラリー、ならびにそれらを構成する要素、ならびにそれらの製造方法および利用方法，学校法人慶應義塾, 特許2004-513488; 特許4747292 (2011.5.27)
  • 柳川弘志，根本直人，宮本悦子：タンパク質のラベル化組成物およびタンパク質のラベル化方法，特願平10-133170，特許4240574 (2009.1.9)
  • 宮本悦子，高嶋秀昭，柳川弘志：対応付け分子とＣ末端ラベル化蛋白質の複合体および対応付け分子の複合体，ならびにそれらの複合体を利用した蛋白質間相互作用解析方法，特願2001-374913,特願2002-172132，特許4030019 (2009.10.26)
  • 柳川弘志，土居信英，宮本悦子，高嶋秀昭，小山理恵子：C末端修飾タンパク質およびその製造方法，ならびに，C末端修飾タンパク質の製造に用いる修飾剤および翻訳テンプレート，ならびに，C末端修飾タンパク質を用いたタンパク質相互作用の検出方法，特願2000-373105，特許3750020 (2005.12.16)
  • 柳川弘志，宮本悦子，松村展敬，土居信英，舘山誠司，石坂正道：物質と蛋白質との間の相互作用の検出方法，物質と相互作用する蛋白質のスクリーニング方法，及び物質とその物質と相互作用する蛋白質との複合体の形成方法，特願2001-239175，特許3706942 (2005.8.12)
  • 柳川弘志，根本直人，宮本悦子，伏見譲：遺伝子型と表現型の対応付け分子及びその利用，特願平08-274855，特許3683902 (2005.6.3)
  • 中村由香，泉貴雄，村田弘，宮本悦子：画像形成装置および画像形成方法，特願平07-214361，特許3618015 (2004)
  • 宮本悦子，村田弘，中村由香：異形電子写真用トナー，特願2001-383677，特許3587816 (2004)
  • 宮本悦子，神山三明，加賀英一：静電潜像現像用現像剤，特願平05-176993，特許3441486 (2003)
  • 宮本悦子，石坂正道，柳川弘志：c-Fos蛋白質と複合体を形成する蛋白質，ならびに，それをコードする核酸，ならびに，それらの利用方法，特願2002-360039, 特許4478772 (2002.3.26)
  • 宮本悦子，石坂正道，柳川弘志：対応付け分子およびその構成要素のライブラリーの製造方法と利用方法，特願2002-360039，特許4441623 (2002.1.22)
  • 宮本悦子，泉貴雄，村田弘，中村由香：現像剤の製造方法，特願平07-062503，特許3375193 (2002)
  • 宮本悦子，村田弘，加賀英一：現像剤およびこれを用いる画像形成装置，特願平05-236006，特許3361366 (2002)
  • 宮本悦子，村田弘，中村由香：異形樹脂粒子，樹脂粒子の異形化方法，及び異形樹脂微粒子からなる電子写真用トナー，特願平06-273120，特許3277068 (2002)
  • 村田弘，加賀英一，宮本悦子：現像剤および画像形成装置，特願平05-066294，特許3277068 (2002)
  • 宮本悦子，村田弘，中村由香，加賀英一：ミクロンサイズ重合粒子およびその製造方法，特願平06-083612, 特許3250907 (2001)
  • 宮本悦子，泉貴雄，村田弘，中村由香：現像剤の製造方法，特願平07-062503，特許3225175 (2001)
  • 宮本悦子，加賀英一，村田弘：電子写真用現像剤，特願平05-067096，特許3222976 (2001)
  • 宮本悦子，加賀英一，村田弘：電子写真用現像剤及びその製造方法，特願平05-229641 (2001)

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国内特許 (出願)National Patent Applications

  • 宮本　悦子, 藤森　茂雄: 標的物質と相互作用するタンパク質の検出方法, 国立大学法人東京大学（WO01），世界知的所有権機関（WIPO）, 公開番号: WO2012/047785 (2013)
  • 宮本　悦子, 辻　融, 藤森　茂雄, 石坂　正道: 生体分子相互作用解析ツールの構成とそれを用いた解析方法, 国立大学法人東京大学（JＰ02），日本、公開番号: WO2011/125833 (2013)
  • 宮本悦子，堀澤健一，柳川弘志：c-Jun蛋白質と複合体を形成する蛋白質，ならびに，それをコードする核酸，ならびに，それらの利用方法，国立大学法人東京大学, 特願2005-516432 （名義変更日：2011年9月14日）
  • 宮本悦子，藤森茂雄：標的物質と相互作用するタンパク質の検出方法，国立大学法人東京大学，特願2011-213424 (2011)
  • 宮本悦子，辻融，藤森茂雄：生体分子相互作用解析ツールの構成とそれを用いた解析方法，学校法人慶應義塾，特願2010-82991 (2010)
  • 宮本悦子，鷲尾尊規，石坂正道，柳川弘志：配列データの取得方法ならびにそれらを利用したターゲット遺伝子の抽出方法および蛋白質の設計方法，特願2005-354344 (2005)
  • 宮本悦子，柳川弘志：遺伝子および/又は蛋白質のデータベースを用いた相互作用マップの作製方法，ならびに，それを実現するためのソフトウエアおよび装置， 特願2003-391368 (2003)
  • 柳川弘志，根本直人，宮本悦子：タンパク質のラベル化化合物およびその化合物を用いたタンパク質のラベル化方法，特願平10-133170 (1998)
  • 泉貴雄，村田弘，中村由香，宮本悦子：画像形成装置用現像剤，特願平07-131976 (1995)
  • 宮本悦子，村田弘，加賀英一：樹脂粒子の製造方法及び現像剤の製造方法，特願平06-051952 (1994)
  • 宮本悦子，加賀英一，村田弘：電子写真用現像剤及びその製造方法，特願平05-229641 (1993)
  • 宮本悦子，村田弘，加賀英一：トナー及びトナーの製造方法，特願平05-067106 (1993)
  • 宮本悦子，村田弘，加賀英一：トナー，トナーの製造方法及び画像形成装置，特願平05-056406 (1993)
  • 加賀英一，村田弘，宮本悦子：クリーニング装置，特願平04-255002 (1992)
  • 宮本悦子，村田弘，加賀英一：電子写真用現像剤及び画像形成方法，特願平04-224128 (1992)
  • 宮本悦子，加賀英一，村田弘：電子写真用現像剤及びその画像形成方法，特願平04-253263 (1992)
  • 村田弘，泉貴雄，瀬戸尚子，宮本悦子：画像形成装置及び現像剤，特願平03-344711 (1991)
  • 宮本悦子，泉貴雄，村田弘：画像形成方法，特願平03-284769 (1991)

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招待講演・口頭講演Invited Talks

  • 宮本悦子：次世代の個の医療のためのIVVディスプレイ法を基盤としたインタラクトーム医科学の展開, 東京理科大 生命医科学研究所　招待セミナー, 千葉, 2014.
  • 宮本悦子：ピューロマイシンを利用したたんぱく質検出技術が拓くインタラクトーム医科学, 東京理科大　第５１回同窓学位取得者記念講演会・祝賀会, 東京, 2013.
  • 宮本悦子：ピューロマイシンテクノロジのあゆみ -第3回資生堂女性サイエンスグラント受賞のインパクト-, 日本女性科学者の会　第９回学術大会, 東京, 2012.
  • Miyamoto-Sato, E.: Next-generation sequencing to generte interactome data for understanding and control of cancer stems cells. 19th East Asia Joint Symposium on Biomedical Research. Miyagi, Seoul (2012)
  • Miyamoto-Sato, E.: Toward Understanding and Control of Cancer Stem Cells using IVV-HiTSeq for Personal Omics. 7th International Symposium of the Institute Network. Miyagi, Japan. (2012)
  • 宮本悦子：個別医療にむけたがん融合研究, 日本女性科学者の会例会 (招待講演) (2011)
  • 宮本悦子：パーソナルゲノム医療に向けたがん幹細胞の理解と制御，第34回日本分子生物学会年会ワークショップ，オーガナイザー兼講演者，横浜 (2011)
  • Miyamoto-Sato, E., :Detecting protein-protein interactions using the in vitro virus method combined with massively parallel sequencing. Computational Biology.Cold Spring Harbor Asia Conferences 2010,Suzhou (2010)
  • 宮本悦子：地球生命の起源を探る(ゲノム情報の起源），横浜国立大学 (2010)
  • 宮本悦子：システム合成生物学の視点：—人工生命の起源と進化ー，放送大学 面接授業 (2010)
  • 宮本悦子，柳川弘志 ：ゲノムネットワーク解析が拓く新たな医療・バイオの世界，第32回日本分子生物学会年会ワークショップ，オーガナイザー兼講演者，横浜 (2009)
  • Miyamoto-Sato, E.,:Toward refining protein interactome for human transcription factor complexes using in vitro virus(IVV).Network Biology2008, London (2008)
  • 宮本悦子：IVV法によるインタラクトーム解析とバイオメディカルへの展開，慶應義塾大学先端生命科学研究所大学院「先端研究(BI）」バイオ先端研究特別講義，藤沢 (2008)
  • 宮本悦子：ピューロマイシンテクノロジーによるゲノム機能解析とバイオメディカルへの展開，横浜国立大学工学部バイオコース 特別講義，横浜 (2008)
  • Miyamoto-Sato, E.:Toward a comprehensives analysis of human transcription factor networks using IVV. ICSB2006, Yokohama (2006)
  • 宮本悦子，柳川弘志：IVV法による大規模タンパク質相互作用解析からゲノム創薬へ，日本分子生物学会2006フォーラム 分子生物学の未来，オーガナイザー兼講演者，名古屋 (2006)
  • 宮本悦子：バイオ分野におけるIT企業とアカデミアのリサーチコラボレーション，日本IBM東京基礎研究所招待講演，大和 (2006)
  • 宮本悦子：大規模PPI解析の意義：生物学的特性や知見は得られるか？-In vitro virus(IVV)法を用いた大規模PPI解析実験とネットワーク解析を通して-，The21stCentury COE WS2006招待講演，湘南 (2006)
  • 宮本悦子，柳川弘志：進化分子工学から生まれたピューロマイシンテクノロジー(IVV法とＣ末端ラベル化法）によるタンパク質間相互作用解析－そこから学ぶ進化の多様性－，第31回生命の起源および進化学会年会招待講演，山形 (2006)
  • 宮本悦子：科学の発展を目指した理想のwet&dryの連携を目指して-In vitro virus(IVV)法におけるwet&dry連携の具体例を通して-，The21stCentury COE WS2005招待講演，湘南 (2005)
  • 宮本悦子：IVV法とC末端ラベル化法の概要，インビトロジェン招待講演，東京 (2005)
  • 宮本悦子：生命のしくみを解くためのツールづくり：試験管内で"コピー可能な"タンパク質をつくる，一般市民講演 文部科学省：科学技術振興調整費成果発表会「もっと知りたい化学の最先端をご紹介」東京 (2005)
  • 宮本悦子：In vitro virus(IVV)法によるゲノムネットワーク解析，富士通(株）主催，バイオ基礎研究の最前線・研究事例ご紹介招待講演，東京 (2004)
  • 宮本悦子，柳川弘志：In vitro virus法による蛋白質相互作用解析；生物機能解明に向けた信頼性の高いゲノムネットワーク解析，振興調整費によるゲノムフロンティア研究公開シンポジウム招待講演，横浜 (2004)
  • Miyamoto-Sato, E.,: Construction of a screening system for comprehensive analysis of protein interactions using in vitro virus. The5th International Workshop on Advanced Genomics, Yokohama (2003)
  • 宮本悦子，柳川弘志： In vitro virus法による網羅的遺伝子 ネットワーク解析，第3回日本蛋白質科学会年会シンポジウム招待講演，北海道 (2003)
  • 宮本悦子，柳川弘志：ポストゲノム機能解析のためのIn vitro virus法による遺伝子ネットワーク解析システム，第24回日本分子生物学会年会シンポジウム，オーガナイザー兼講演者，横浜 (2001)
  • 宮本悦子，Burnette, J.M., Bomzw, H.,小林憲正，柳川弘志, Lopez, A.J. ゼロサイズ・エクソンによる長いイントロンの段階的スプライシングと示唆される遺伝子と蛋白質の進化機構，第25回生命の起源および進化学会年会(オーラル)，横浜 (2000)
  • 宮本悦子，根本直人，小林憲正，柳川弘志：蛋白質のin vitro selectionにおける対応付け分子構築のためのピューロマイシンの性質の検討，第25回生命の起源および進化学会年会(オーラル），横浜 (2000)
  • Miyamoto-Sato, E. and Lopez, A.J.：Evidence for a ratchetting mechanism to remove large intron in Ultrabithorax RNAs. RNA '98 Meeting,Madison,USA (1998)
  • 宮本悦子，根本直人，伏見譲，小林憲正，柳川弘志 :進化分子工学におけるウイルス型対応付け分子の構築(オーラル)，第22回生命の起源および進化学会年会，長岡 (1997)

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国際学会発表（招待講演，口頭発表など）Inernational Conferences

  • Fujimori, S.: Development of a high-throughput interactome analysis pipeline for understanding cancer stem cell characteristics. 19th East Asia Joint Symposium on Biomedical Research. Miyagi, Seoul (2013)
  • Miyamoto-Sato, E.: Toward Understanding and Control of Cancer Stem Cells using IVV-HiTSeq for Personal Omics. 7th International Symposium of the Institute Network. Miyagi, Japan. (2012)
  • Fujimori, S., Hirai, N., Masuoka, K., Miyamoto-Sato, E.: Towards personal interactomes using a display technology combined with next-generation sequencing. Personal Genomes. Cold Spring Harbor, USA (2011)
  • Fujimori, S., Hirai, N., Miyamoto-Sato, E.: A database and viewer for protein interacting regions. The 9th International Workshop on Advanced Genomics. Tokyo Japan (2011)
  • Fujimori, S.,and Miyamoto-Sato, E.:Detecting protein-protein interactions using the in vitro virus method combined with massively parallel sequencing. Computational Biology. Cold Spring Harbor Asia Conferences 2010,Suzhou (2010)
  • Miyamoto-Sato, E.,.: Toward refining protein interactome for human transcription factor complexes using in vitro virus (IVV). Systems Biology. Networks 2010.Cold Spring Harbor Laboratory ,London (2010)
  • Miyamoto-Sato, E., Ishizaka, M., Fujimori, S., Hirai, N., Masuoka, K., and Yanagawa, H.: Toward refining protein interactome for human transcription factor complexes using in vitro virus (IVV). Network Biology 2008, London (2008)
  • Fujimori, S., Ishizaka, M., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Towards structure prediction of protein complexes using information of interaction regions determined by the in vitro virus method. 1st Joint Workshop on Computational Science 2008, Wako (2008)
  • Ozawa, Y., Saito, R., Shigeo, F., Yanagawa, H., Miyamoto-Sato, E., and Tomita, M.: A novel method considering binding domain independency for extracting protein complexes. ISBM 2008, Toronto (2008)
  • Saito,R., Ozawa,Y., Fujimori,S., Matsui,M., Ushiama,S., Ishizaka,M., Yanagawa,H., Miyamoto-Sato,E., and Tomita,M.: Comprehensive Analysis of Domain-Domain Interactions Using In vitro Virus. ISBM 2008, Toronto (2008)
  • Ozawa, Y., Saito, R., Kashima, H., Yanagawa, H., Miyamoto-Sato, E., and Tomita, M.: A novel method considering binding domain independency for extracting protein complexes. Genome Informatics Workshop 2007, Singapore (2007)
  • Saito, R., Ozawa, Y., Fujimori, S., Matsui, M., Ushiama, S., Kashima, H., Yanagawa, H., Miyamoto-Sato, E., and Tomita, M.: Comprehensive Analysis of Domain-Domain Interactions Using In vitro Virus. Genome Informatics Workshop 2007, Singapore (2007)
  • Kratz, A., Saito, R., Krishnan, A., Yanagawa, H., Miyamoto-Sato, E., and Tomita, M.: Impact of Alternative Transcription Initiation and Alternative Splicing on the Human Protein-Protein Interaction Network. JSBi 2007, Tokyo (2007)
  • Umeki. H., Fujimori. S., Yanagisawa. N., Washio, T., Miyamoto-Sato, E., Tomita. M., and Yanagawa. H.: Search for causative functional SNPs using in vitro virus method. ICSB2006, Yokohama (2006)
  • Miyamoto-Sato, E., Ishizaka, M., Fujimori. S., Saito, R., Washio, T., Hirai, N., Masuoka, K., Yamashita, T., Oshikubo, T., and Yanagawa, H.: Toward a comprehensives analysis of human transcription factor networks using IVV. ICSB2006, Yokohama (2006)
  • Kosugi, S., Hasebe, M., Matsumura, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Consensus patterns for importin α-dependent nuclear localization signals. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Tabata, N., Sakuma, Y., Honda, Y., Onimaru, M., Matsunaga, S., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Rapid selection of mouse single-chain antibody with high affinity and selectivity by In vitro virus method. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Horisawa, K., Tateyama, S., Takashima, H., Matsumura, N., Miyamoto-Sato, E., Doi, N., and Yanagawa, H.: Highly sensitive method to hunt for protein-protein interactions using in vitro virus method combined with DNA microarrey. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Tateyama, S., Horisawa, K., Takashima, H., Doi, N., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Analysis of ranscriptional regulatory networks using in vitro virus (IVV) method. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Fujimori, S., Yamashita, T., Oshikubo, T., Akasaka, H., Takamiya, K., Ishizaka, M., Washio, T., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Development of analysis system for large-scale experiments of protein-protein interactions using in vitro virus (IVV), IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Washio, T., Yanagisawa, N., Kitagawa, N., Fujimori, S., Umeki, H., Tomita, M., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Comprehensive functional analysis of splice variants using in vitro virus. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Saito, R., Miyamoto-Sato, E., Yanagawa, H., and Tomita, M.: A comprehensive analysis of motif-motif interactions using In vitro virus. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Ishizaka, M., Hirai, N., Wada, K., Matsumoto, Y., Masuoka, K., Sugiyama, J., Oshikubo, T., Akasaka, H., Takamiya, K., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Optimization of conditions of selection for a large-scale analysis of protein-protein interaction using in vitro virus (IVV). IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Miyamoto-Sato, E., Ishizaka, M., Rintaro, S., Washio, T., Hirai, N., Masuoka, K., Yamashita, T., Oshikubo, T., Akasaka, H., Takamiya, K., Sugiyama, J., Matsumoto, Y., and Yanagawa, H.: Toward human transcription factor interactome using in vitro virus (IVV) -Extracting minimum interaction regions for genome-based drug discovery-. IUBMB2006, Yokohama (2006)
  • Tateyama, S., Takashima, H., Horisawa, K., Miyamoto-Sato, E., Doi, N., and Yanagawa, H.: In vitro virus (IVV): DNA-binding protein complexes discovery, interaction analysis and protein binding domain mapping. Pacifichem 2005, Hawaii (2005)
  • Horisawa, K., Tateyama, S., Ishizaka, M., Matsumura. N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Doi, N., and Yanagawa, H.: In vitro selection system for protein- protein interactions by using in vitro virus technique. Pacifichem 2005, Hawaii (2005)
  • Horisawa, K., Tateyama, S., Ishizaka, M., Matsumura, N., Takashima, H., Miyamoto-Sato, E., Doi, N., and Yanagawa, H.: In vitro selection of Jun-associated proteins by using In vitro virus technique. HUGO's 10th Human Genome Meeting Kyoto (2005)
  • Horisawa, T., Miyamoto-Sato, E., Ishizaka, M., Tateyama, S., Takashima, H., and Yanagawa, H.: Construction of a screening system for comprehensive analysis of protein interactions using in vitro virus. The 5th International Workshop on Advanced Genomics, Yokohama (2003)
  • Kawahashi, Y., Doi, N., Takashima, H., Tsuda, C., Oishi, Y., Oyama, R., Yonezawa, M., Miyamoto-Sato, E., and Yanagawa, H.: Development of the In vitro protein microarray system for high-throuput analysis of protein interaction. The 5th International Workshop on Adva Genomics, Yokohama (2003)
  • Doi, N., Takashima, H., Kinjo, M., Sakata, K., Kawahashi, Y., Oishi, Y., Oyama, R., Miyamoto-Sato, E., Sawasaki, T., Endo, Y., and Yanagawa, H.: Novel fluorescence labeling and high-throughput assay technologies for In vitro analysis of protein interactions. The 4th Intrnational Workshop on Advanced Genomics, Yokohama (2001)
  • Burnette, J.M., Miyamoto-Sato, E., Bomze, H.M., and Lopez, A.J.: Stepwise removal of a large intron mediated by a zero- nucleotide exon. DROS '99 Washington, D.C., USA (1999)
  • Yanagawa, H., Miyamoto-Sato, E., and Nemoto, N.,: Fluorescence labeling of proteins with puromycin analogs. ABRF '99 Bioinformatics and Biomolecular Technologies, Durham,North Carolina, USA (1999)
  • Miyamoto-Sato, E., Burnette, J.M., Bomze, H.M., and Lopez, A.J.：Evidence for a ratchetting mechanism to remove large intron in Ultrabithorax RNAs. RNA '98 Meeting, Madison, USA (1998)

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